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Suite2p
: I7 |# Z/ o, U8 t$ E' ^ 用于处理双光子钙成像数据的管道。 版权所有(C)2018 Howard Hughes Medical Institute Janelia Research Campus! b6 ^8 Y$ C% f6 H: \
suite2p包含以下模块:
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# |9 S! ?6 k8 r L( L7 L5 H( [9 `细胞检测
) I7 i! O5 |; r6 N( K峰值检测
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该代码由Carsen Stringer和Marius Pachitariu编写。 要获得支持,请打开一个。 参考文件在。 反卷积算法是基于,其设置基于 。- Z7 u4 X8 o1 }5 `+ F3 B* |6 k" T
有关GUI演示,请参见此twitter。
4 X' R n) o; _7 [* R: J 您可以找到matlab版本。 请注意,该算法较旧,在非圆形ROI上效果不佳。
: h- [& y, t6 S8 t9 ~ 有关suite2p的工作原理的演讲,请。2 {9 w7 v5 l: n8 Z- ^
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安装0 l8 ?0 j/ H# i+ j1 Z6 O- n5 e& }
安装Python的发行版-选择Python 3.x和您的操作系统。 请注意,如果未将anaconda添加到路径,则可能需要使用anaconda提示符。
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