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suite2p:钙成像记录中的细胞检测-源码

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发表于 2022-7-20 16:12:02 | 显示全部楼层 |阅读模式
Suite2p
: I7 |# Z/ o, U8 t$ E' ^ 用于处理双光子钙成像数据的管道。 版权所有(C)2018 Howard Hughes Medical Institute Janelia Research Campus! b6 ^8 Y$ C% f6 H: \
suite2p包含以下模块:
4 X8 q9 H% V5 [' u- n; z 登记
# |9 S! ?6 k8 r  L( L7 L5 H( [9 `细胞检测
) I7 i! O5 |; r6 N( K峰值检测
& L! r* t$ E2 A可视化GUI/ p* e3 V* B" U2 i4 u
该代码由Carsen Stringer和Marius Pachitariu编写。 要获得支持,请打开一个。 参考文件在。 反卷积算法是基于,其设置基于 。- Z7 u4 X8 o1 }5 `+ F3 B* |6 k" T
有关GUI演示,请参见此twitter。
4 X' R  n) o; _7 [* R: J 您可以找到matlab版本。 请注意,该算法较旧,在非圆形ROI上效果不佳。
: h- [& y, t6 S8 t9 ~ 有关suite2p的工作原理的演讲,请。2 {9 w7 v5 l: n8 Z- ^
阅读位于的文档! P7 x/ n9 n/ K9 n3 c/ _
安装0 l8 ?0 j/ H# i+ j1 Z6 O- n5 e& }
安装Python的发行版-选择Python 3.x和您的操作系统。 请注意,如果未将anaconda添加到路径,则可能需要使用anaconda提示符。
: h8 c# j6 R9 Y$ D 从资源库下载文件。 您可以通过克隆存0 C) M8 U0 [1 X* z

* |, L. C  ?7 G8 M& W1 k
; h* ~' Y8 }: @" G资源下载地址和密码(百度云盘):
游客,如果您要查看本帖隐藏内容请回复
[/hide] 百度网盘信息回帖可见
9 `$ k' R: B* ]8 ?; y2 j  L
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: w4 A1 \( ]' t4 K2 z9 W, K# e
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    发表于 2022-8-31 23:57:21 | 显示全部楼层
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    发表于 2022-9-20 21:03:50 | 显示全部楼层
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    发表于 2022-10-10 09:56:21 | 显示全部楼层
    VERY GOOOOOOD
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    发表于 2022-10-31 14:36:39 | 显示全部楼层
    努力学习努力学习努力学习
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    发表于 2022-11-16 20:51:22 | 显示全部楼层
    找了好久了
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    发表于 2022-12-9 17:08:43 | 显示全部楼层
    学习学习再学习
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    发表于 2022-12-29 20:29:17 | 显示全部楼层
    哈哈哈哈哈,开心
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