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suite2p:钙成像记录中的细胞检测-源码

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发表于 2022-7-20 16:12:02 | 显示全部楼层 |阅读模式
Suite2p
; X& P- f6 }' ~' ?2 U 用于处理双光子钙成像数据的管道。 版权所有(C)2018 Howard Hughes Medical Institute Janelia Research Campus
2 V: C+ L5 a7 `- `  |0 a suite2p包含以下模块:* P6 l- a4 k. w" k" j$ `
登记) s. Y+ R6 |% @5 W4 l3 u
细胞检测. u4 g) v( \/ h& M8 K# A3 d
峰值检测
/ K; z/ x! v% @; J# a$ S# Q可视化GUI$ a/ g2 M6 ~1 f" d: a4 _, i
该代码由Carsen Stringer和Marius Pachitariu编写。 要获得支持,请打开一个。 参考文件在。 反卷积算法是基于,其设置基于 。, e6 d- n2 J6 T- R+ A# Z
有关GUI演示,请参见此twitter。+ Z% d/ p0 a& Y! ^
您可以找到matlab版本。 请注意,该算法较旧,在非圆形ROI上效果不佳。9 p& b6 Z$ Y/ c8 k& @
有关suite2p的工作原理的演讲,请。
8 g9 B" ^8 Q' F& ^1 K阅读位于的文档
7 [5 j- E" A/ k安装; l) c# Q9 P( p/ T5 m9 X
安装Python的发行版-选择Python 3.x和您的操作系统。 请注意,如果未将anaconda添加到路径,则可能需要使用anaconda提示符。7 h" v, y9 l5 T" O9 \
从资源库下载文件。 您可以通过克隆存7 ~6 Y* O$ s0 _3 W6 s2 i; n
! x1 J& N6 k" s+ i
' I+ f  z& f$ q. }
资源下载地址和密码(百度云盘):
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3 p' A! ~; @  c( D; s, U" a3 a
1 x+ E0 v+ W+ H0 D) [* ~
* O6 [6 w- V, T3 W& K+ E+ o
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    发表于 2022-8-31 23:57:21 | 显示全部楼层
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    发表于 2022-9-20 21:03:50 | 显示全部楼层
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    发表于 2022-10-10 09:56:21 | 显示全部楼层
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    发表于 2022-10-31 14:36:39 | 显示全部楼层
    努力学习努力学习努力学习
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    发表于 2022-11-16 20:51:22 | 显示全部楼层
    找了好久了
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    发表于 2022-12-9 17:08:43 | 显示全部楼层
    学习学习再学习
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    发表于 2022-12-29 20:29:17 | 显示全部楼层
    哈哈哈哈哈,开心
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