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医学数据挖掘精品课程-GEO、TCGA、Oncomine数据库,夸克网盘资源,免费下载。本系列课程将以视频的方式跟大家一起交流数据挖掘的神奇之处,用R软件和perl带大家玩转基因数据,从最简单的数据下载到最后我们绘制一张5年生存率,这桌饕餮盛宴,一定符合大家的口味。目前市面上较少有系统的数据挖掘方面的视频,很多资料也是零零散散,我们将其进行整理,按照挖掘的一般流程跟大家进行讲解,整个思路将会非常清晰。现在分析基因数据的软件非常多,有些有文献支持,有些有点山寨、对于很多初学者其实非常不容易选择。我们不仅会在第二讲中会讲GEO的一些在线工具,更多地我们选择目前最常用,也是最经典的两种编程软件,R和PERL跟大家进行讲解。这两种软件也是目前功能非常最为强大的编程工具,几乎可以解决数据挖掘方面的绝大部分操作。其中用R软件做出的可视化效果非常好,不是一般普通软件可以替代,而且可以进行不断加工和优化。其次,编程的代码已经帮大家整理好,大家并不需要担心自己不会编程,只要照着视频做,一般不会有太大问题。现在数据库有很多,我们这次课程主要选择了GEO和TCGA,分别是当前最全面的数据库和最大的肿瘤数据库,掌握这两个数据库,可以帮助大家解决科研方面很多问题。最后一点,我们此次的教学目的很简单,不提倡走马观花地学习各种数据库,而是踏踏实实将这两个重要的数据库的操作讲解给大家听。我们保证这套视频都是实实在在的干货,只讲学员最为关心的内容,不会穿插与课程不相关的内容。
( n# |; \4 l4 A' x! |! }. z├── 1数据挖掘概述.mp45 c6 G* M" U4 S0 n/ H9 b
├── 2.GEO在线工具的应用.mp46 ~8 G9 m7 N5 V% p& F2 m
├── 3.GEO数据下载和数据质量分析.mp4
. Q }6 k S' v$ m0 u; n) k├── 4.原始数据预处理.mp44 F% S# h: n* S9 p
├── 5.寻找差异基因及制作热图和火山图.mp4
- I. D2 o& B+ [% {( K├── 6.GO富集分析.mp4: [+ |/ [9 R! r/ I7 l: f% u
├── 7.KEGG分析(修复).mp4
& @7 m3 K9 b, X5 E2 r├── 8.蛋白互作网络.mp41 X- h5 _2 V y/ _6 u5 b" u9 y# X+ J
├── 9.TCGA数据下载.mp4
+ Y8 ~4 d# X$ Q+ n& L. L1 M├── 10.TCGA数据整理和基因注释.mp4
& F7 Y) j3 A) L" [7 n5 ~/ Y├── 11.寻找差异基因和制作5年生存率.mp4$ D, X O, y% \9 g7 u9 n% q
├── 12.Oncomine概述及Meta分析.mp4
) s& I8 } L2 A8 E/ J- c: {( o├── 13.Oncomine之差异分析及共表达分析.mp40 n8 P% u+ |% m& t! t( N R
├── 课程脚本代码.zip5 o; {0 B ~* D) W7 M6 ?) j
; F( P0 W0 D7 J* [' j8 B) B
0 f8 I9 @7 c( v, O* M; i- u
B8 n8 `4 k, v. o7 B2 \* ~8 C5 i( h# A( {9 y2 N6 r# G
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资源下载地址和密码(百度云盘): [/hide] 百度网盘信息回帖可见- Y: g0 W" X p
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